Ами ще споделя каквото ми е направило впечатление
Една от разликите е, в дистрибуциите. Ползват едно и също ядро, но от там нататък софтуера с който идват се различава. Така че в зависимост от дистрибуцията, ще имаш и някои разлики в начина на настройки и програмите, които първоначално идват. Както и в начина на инсталиране на нови програми. Интерфейса на графичната среда е интуитивен също като на windows, макар че има някои разлики, но не е нещо фрапиращо а напротив - даже на мен ми беше забавно.
Имай предвид, че т. нар. контролен панел който познаваш от windows не е подреден по същият начин. И изобщо настройките които можеш да правиш не са подредени както в windows, но пък и не е кой знае колко разбъркано.
Друга голяма разлика е, че Linux си номерира дяловете на хард диска по различен начин ако при windows имаш дял C: D: при Линукс е нещо от сорта на /dev/sda0, /dev/sda5, които на всичкото отгоре трябва да са монтирани някъде, но обикновено това става автоматично. Папката /home/USERNAME за всеки потребител на Linux е нещо подобно на My Documents в Windows.
Файловата система също е по-различна. Има една глaвна папка - /. Всичко останало - дискови дялове, DVD устройства, флопи и т.н. са някъде по-надолу, а не както при windows да са на отделни устройства и всяко устройство със своя собствена най горна папка \
Още нещо - под Linux не се работи с администраторски права. Тoва е закон. Администраторски права се искат само когато се правят някои настройки или се инсталира някакъв софтуер и за други по специфични нужди. Но да влезеш в графичната среда и да работиш като администратор - абсурд. Ако и потребителите на windows ползваха същото правило, щяха да си имат много, ама много по-малко проблеми.
Месинджъри за Линукс има.
Може да си имаш проблеми с инсталирането и настройването на някой по-специфичен хардуер под Линукс - Microsoft не дават кокала толкова лесно и производителите на хардуер по принцип първо гледат да си уредят отношенията с windows, пък за Linux я се сетят я не. Трябва ада се разчита на по-общи драйвери и/или такива правени на доброволни начала от някой ентусиаст.