Master Boot Record-а се състои от IPL и PT.Съответно за да се продължи boot процеса трябва да се достигне до boot записа на самия дял(конкретно за windows-ntldr)---->boot.ini--->windows boot screen...
Конкретно за въпроса ти:MBR е на този хард диск,който е bootable,обикновено той се определя като hd0.
PS:кой е bootable хард диска ти може да видиш в BIOS .Boot процеса умишлено ти го представих набързо-мисля,че ще ти е от полза,ако не го знаеш.