Намери си папката Startup подобно на така:
C:\Documents and Settings\All Users\Start Menu\Programs\Startup |
После в нея направи Shortcut на програмата, която ти трябва.
Може да я сложиш програмата /името с разширение и всичкия път до нея/ във файла Autoexec.bat и ще се пуска преди Windows.