Skin Studio e програма на фирмата Star Dock и по принцип се води най-сериозният софтуер за тази цел. Ама правенето на тема за уина не е шега работа. Аз се занимавам с графични чакълъци от много време и все още не съм се решил да седна да правя теми. Ето един тъториъл, който смятам, че ще ти е от полза
Тъториъл - PDF 350 KB.
Също така не е лошо да имаш подръка и програмите
Resource Hacker и
PE Explorer