Express FTP Pilot се отличава с няколко детайла. Първо, доста необичайния интерфейс на програмата. Обичайната разбивка на четири екрана - но нито един от тях не съдържа информация за локалната система. Оттук следва и липсата на функцията drag-and-drop. Всички операции се осъществяват главно чрез диалогови прозорци, което е неудобно за често повтарящите се операции.